Отдел ФСБ России по ОГВ(с) в СКР сформирован 20 сентября 2012 года на базе Оперативной группы в СКР ДВКР ФСБ России, которая в свою очередь была создана в 1999 году для контрразведывательного обеспечения проводимой контртеррористической операции и имела начальное наименование Временная оперативная группа (ВОГ) Управления военной контрразведки ФСБ России в Северо-Кавказском регионе.
За период работы оперативной группы руководители и сотрудники приложили немало усилий для наведения конституционного порядка на территории Северо-Кавказского региона. На основе информации оперативной группы ликвидировано значительное число лидеров и участников НВФ, бандгрупп, выявлено огромное число баз боевиков, схронов и тайников с оружием и боеприпасами. Многие руководители и сотрудники отмечены высокими государственными наградами.
Сформированный в 2012 году отдел ФСБ России по ОГВ(с) в СКР продолжил деятельность по борьбе с терроризмом и экстремизмом и не утратил заложенные годами традиции.
На протяжении многих лет сотрудники с честью выполняют возложенные задачи, зачастую с риском для жизни. Результатом является стабильно снижающийся уровень терроризма, спокойная жизнь граждан в СКР.
В торжественных мероприятиях приняли участие руководство УФСБ России по ФСВНГ, УФСБ России по Чеченской Республике, ПУ ФСБ России по Чеченской Республике, ветераны оперативной группы и отдела, сотрудники и члены их семей.
На торжественном митинге выступил почётный гость - первый руководитель оперативной группы ДВКР ФСБ России - Герой России генерал-лейтенант Олег Михайлович Дуканов, который сердечно поздравил личный состав отдела, ветеранов и присутствовавших лиц.
В память о военных контрразведчиках, погибших в период проведения контртеррористической операции на территории Северного Кавказа, состоялась церемония возложения цветов к монументу памяти.
Для гостей и ветеранов организован выезд в с. Улус-Керт Шатойского района Чеченской Республики, где на высоте 776 проведены торжественно-памятные мероприятия у поклонного креста, установленного в честь погибших в этих местах в 2000 году десантников 6 роты 104 Гвардейского десантно-штурмового полка.
На территории отдела для всех участников мероприятий была организована выставка состоящей на вооружении в войсках Росгвардии бронетехники и стрелкового вооружения. Для детей и членов семей организован сладкий стол.